大赛采用“公开海选”和“揭榜挂帅”两种方式，面向社会公开征集具有颠覆性技术苗头的项目参赛，通过层层筛选和项目比拼，择优推荐参赛项目进入科技部颠覆性技术备选库。符合参赛条件的单位统一登录全国颠覆性技术创新大赛官方网站（http://dfxjs.cxcyds.com）报名参赛。

       同一参赛单位（大专院校除外）需在两种方式中择一参赛，不得重复报名，且仅可报名1个项目参赛。大专院校可同时选择两种参赛方式，且两种参赛方式报名项目总数量不超过3个，但同一项目只能申请一种参赛方式，不得重复报名。比赛不向参赛单位收取任何费用。